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目前大多數(shù)商業(yè)化的核酸染料(凝膠染色試劑)總是在安全性、穩(wěn)定性和靈敏性等方面不*令人滿意。例如，雖然 EB (溴化乙啶)作為目前使用廣泛的核酸凝膠染色試劑，能夠在多數(shù)應用中提供可以接受的靈敏度，但它是一種高誘變性的化學物質。而且EB染色后具有較高的背景熒光信號。
SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被廠家宣傳為靈敏的凝膠染色試劑。但 SYBR Green I 尤其是 SYBR Gold 在常用的微堿性電泳緩沖溶液或預制凝膠中會快速降解，穩(wěn)定性差導致染色效果極不可靠。 SYBR safe 被認為是市場上較為安全的核酸染料 ，但它的染色效果還遠不及 SYBR Green I 。
至于國內有公司宣稱的新產(chǎn)品Goldview，我們不想多加評論。因為從極為相似的對比試驗結果來看，該產(chǎn)品似乎就是AO(丫啶橙 ，一種劇毒產(chǎn)品，且熒光亮度不佳)。請看Goldview 與 AO 對比試驗結果(其中Goldview是從國內某公司采購，AO則來自SIGMA，報告來自開放生物)
GelRed 和 GelGreen 無論用于預制凝膠染色還是凝膠電泳后染色，都表現(xiàn)出了*的靈敏度。為配合 312 nm UV 凝膠成像系統(tǒng)而設計的 GelRed ，在使用了我們新開發(fā)的具有的試驗步驟后(該試驗步驟中使用稀釋的 NaCl 溶液替代傳統(tǒng)的 TBE 緩沖溶液)，在凝膠電泳后染色中優(yōu)于或者至少相當于 SYBR Gold 。但與 SYBR Gold 不同， GelRed 在預制凝膠中使用時仍然有*的靈敏度，事實上GelRed 在檢測低濃度、微量 DNA 方面比 EB 表現(xiàn)出更高的靈敏度，尤其對小分子量的 DNA 檢測非常靈敏(圖1)。 GelGreen 可以滿足使用 488 nm 激光凝膠掃描儀或者可見光激發(fā)的 Dark Reader 的研究人員的使用要求。 GelGreen 無論是在預制凝膠還是凝膠電泳后染色中都與 SYBR Green I 靈敏度相當，但不存在后者的不穩(wěn)定性問題。實際上， GelRed 和 GelGreen ，特別是 GelRed 非常穩(wěn)定，可以長期在室溫下保存。當這兩種染料稀釋在 TBE 或者類似的電泳緩沖溶液中時甚至可以使用微波爐加熱，便于采用常規(guī)方法制備預制凝膠。含有染料的預制凝膠可以成批制備，長期保存。
同樣重要的是， GelRed 和 GelGreen 相比 EB 或 SYBR Green I 提高了安全性。 獨立的測試服務公司( Litron Laboratories, Inc. )進行的標準艾姆斯氏測試結果表明， 在 18.5 μ g /mL (該濃度遠高于推薦用于電泳后染色的 約 4 μ g/mL 的 3X 染色液 )濃度下， GelGreen 沒有誘變性，而 GelRed 也僅在 S9 代謝活化時有微弱的誘變性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化學結構使其難以穿透細胞膜進入細胞，正是這一特性降低了染料的細胞毒性。如圖3。相反， SYBR Green I 廣泛地用于活細胞線粒體和核 DNA 染色，這正是由于它能快速的被細胞吞入。由于已知 SYBR Green I 對紫外線導致的突變有強烈的增強作用( Ohta et al. Mutat. Res. 492 , 91(2001) )，因此它的高細胞膜透性使它在紫外環(huán)境觀察時成為凝膠染色的主要有害物質。
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